En el año 2015 ser una institución líder en la aplicación de métodos y prácticas pedagógicas que les permita a los estudiantes ser generadores de su propio desarrollo personal y social, mediante el aprovechamiento razonable de todos los recursos naturales existentes en la zona de influencia del Colegio.
MISIÓN
Formar personas integrales en los niveles educativos de preescolar, básica, media académica y media técnica, y en las modalidades de escuela nueva (básica rural) y educación de adultos (programa CLEI), que sean honestas, emprendedoras, con capacidad de liderazgo, sentido de pertenencia por el Colegio y por su pueblo, sólidos valores humanos, solidarias, tolerantes, críticas, reflexivas, pro-activas, respetuosas del derecho y capaces de transformar positivamente la realidad en que viven mediante la práctica de competencias básicas, ciudadanas y laborales, que les permita un desarrollo personal, social, cultural y productivo acorde con sus proyectos de vida y la proyección socioeconómica de la región.
CRONOLOGÍA DEL COLEGIO
1945 – 1948: El señor Roque Vargas funda a orillas del Río Lebrija un pequeño caserío con el nombre de Puerto Nuevo. Luego Virgilio Rangel se posesionó de unos terrenos aledaños y construyó una vivienda.
1949: El día 29 de septiembre de este año, reunidos en una tienda, Alejandro Guzmán, Luis Uribe, Héctor Machado, Alván Luna y Antonio Gutiérrez, acordaron que el pequeño caserío se llamaría San Rafael, en homenaje al santo del día y al nombre del líder campesino Rafael Rangel Gómez, muy conocido en la región.
1959: Fundación de la Escuela San Rafael, en varios locales particulares, ubicados en el centro del caserío.
1962: Construcción de la Escuela El Bambú, con el apoyo de la Caja Agraria. Más tarde con la ayuda de la comunidad y el Municipio de Rionegro se abrió otro local llamado La EscuelaCentral.
1975: Construcción de tres aulas de clase frente al Matadero, donde funciona la actual sede del Preescolar.
1982: En una casa de propiedad del señor Pico Martínez, a media cuadra del Parque Principal, con 38 jóvenes, el Reverendo Padre Victor de Jesús López Castro funda el Colegio de bachillerato Juan Pablo II. Después de un año de permanencia en este lugar el Colegio se traslada a la casona donde actualmente funciona la casa de pastoral y el Albergue Parroquial San Rafael. Allí funcionará, dirigido por los sacerdotes de la Parroquia, hasta el año de 1997.
1983: Construcción de cuatro aulas de clase y dos locales para oficinas en la casa del actual ancianato parroquial.
1985: La Secretaría de Educación del Departamento de Santander aprueba el grado noveno, según Resolución 0146 de enero 30 de 1985, siendo Rector el P. Francisco Vargas Pieschacón.
1987: El Colegio funcionó bajo la dirección del P. Marcos Celis.
1989: Apertura de matrículas para el ciclo de educación media.
1990: Son aprobados los estudios de la educación media académica y vocacional y se produce la graduación de la primera promoción de cuatro bachilleres académicos, en el local de la Parroquia. En este año, también, se construyeron tres aulas al fondo de la casa cural bajo la dirección de P. Herbert Monsalve.
1993: El Colegio es departamentalizado mediante la Ordenanza 051 del 7 de diciembre de este mismo año de la Asamblea del Departamento de Santander, es nombrada la primera planta de personal docente y asume como rectora la Señorita Ana Leonor Lozano Cárdenas.
1994: El Ministerio de Educación Nacional aprueba todos los estudios ofrecidos por el Colegio, desde preescolar hasta el grado once, mediante la Resolución No. 6919 del 26 de diciembre de 1994, de la Gobernación del Departamento.
1995: Adquisición de un lote de terreno, de aproximadamente tres hectáreas, en el Barrio Fortuna y construcción de las nuevas instalaciones donde actualmente funciona la sección de secundaria y las oficinas del Colegio.
1997: Traslado de todos los cursos de la secundaria a la nueva sede del Colegio en el Barrio Fortuna.